Фамилия Муллашева происходит от имени Муллаш — так в тюркской среде называли человека, чьё полное имя звучало как Мулладжан. Вторая часть этого составного имени, «джан», переводится с персидского как «душа», «жизнь». Поэтому Мулладжан, а вслед за ним и сокращённый вариант Муллаш, можно осмыслить как «душа наставника» или «дорогой, как душа, наставник».

Здесь стоит остановиться на первой части основы. Слово «мулла» в исламской традиции означает учёного, знатока Корана, духовного наставника. Имя Мулладжан — это не столько указание на профессию предка, сколько почтительное именование, в котором соединились религиозный статус и ласковое, личное обращение. Подобные двусоставные имена с компонентом «джан» (например, Гульджан, Ахмаджан) были широко распространены у народов Средней Азии, Поволжья и Кавказа, и со временем они часто ужимались в более короткие обиходные формы — так Мулладжан и превратился в Муллаша.

Суффикс «-ев» в фамилии указывает на принадлежность: Муллашева буквально означает «дочь или жена Муллаша». Такая модель образования фамилий — от отчества или дедичества, то есть от имени отца или деда, — была типична для многих народов Российской империи в XIX — начале XX века, когда у мусульманского населения начали массово закрепляться наследственные фамилии.

Процесс формирования фамилий был длительным и зависел от региона, сословия и даже от того, как записывало имя местное духовное или светское начальство. Поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Муллашевых можно лишь на основании генеалогических исследований: изучения метрических книг, ревизских сказок и подворных переписей в тех областях, где фамилия встречается чаще всего.

В русской среде фамилия сохранила исходное ударение на втором слоге и характерное для тюркских заимствований сочетание «ш» перед «ев», что делает её легко узнаваемой и отличает от более поздних русифицированных вариантов. Сегодня Муллашевы встречаются преимущественно в Татарстане, Башкортостане и в регионах со значительным тюркским населением, что косвенно подтверждает её восточные корни.