Фамилия Муллокандов — редкая и составная, и её разбор сразу даёт ключ к происхождению. Она образована по арабо-персидской модели, характерной для народов Средней Азии, Кавказа и Поволжья, но с русским суффиксом принадлежности -ов. Основа — два элемента: «мулло» и «канд».

Первый корень, «мулло», восходит к арабскому «мауля» (господин, владыка) и в тюркских языках означает мусульманского священнослужителя, знатока Корана, учителя в медресе. Второй корень, «канд», — распространённый в персидском и тюркских языках топоформант со значением «город», «селение», «крепость» (вспомните Самарканд, Ташкент, Яркенд). Таким образом, Муллокандов — это не прозвище по профессии, а фамилия, указывающая на географическое происхождение: предок носителя был родом из селения, которое называлось Муллаканд (или Муллоканд), то есть «город муллы» или «селение муллы».

Суффикс -ов, добавленный к основе, — классический русский патронимический формант, который в XIX–XX веках массово присоединяли к фамилиям народов Российской империи при оформлении документов. Это даёт понять, что предок Муллокандовых жил на территории, где действовала русская административная система записи фамилий — скорее всего, в Средней Азии (Узбекистан, Таджикистан) или в Азербайджане, где топоним «Муллакенд» встречается в нескольких вариантах. Например, в Азербайджане есть село Моллакенд (Моллакянд), название которого буквально означает «селение муллы».

Версия, что фамилия происходит напрямую от прозвища «Муллоканд» (то есть человек, похожий на муллу из такого-то села), менее вероятна: в тюркской ономастике топонимические фамилии с элементом -канд встречаются чаще, чем прозвищные. Социальный статус предка, скорее всего, был связан с духовенством или образованной прослойкой, но необязательно: жить в «селе муллы» мог и крестьянин.

В написании возможны варианты: Муллакандов, Моллакандов, Моллакендов — в зависимости от местного произношения и адаптации к русской графике. Форма Муллокандов с буквой «о» в первом слоге — результат аканья или диалектного произношения, закреплённого в паспорте. Фамилия крайне редкая, в современных базах данных встречается единично, что подтверждает её узкую локальную привязку.