Фамилия Мурсеев — одна из тех, где корень почти наверняка тюркский, а суффикс — русский, что выдает её происхождение на стыке культур. Основа «Мурсей» или «Мурса» восходит к арабскому имени Мурсаль (Mursal), которое означает «посланный», «посланец». В тюркских языках, особенно у татар и башкир, это имя встречалось в формах Мурса, Мурсей, Мурсалим. Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе добавили патронимический суффикс -ев (после мягкого согласного), что буквально значит «сын Мурсея».

Географически фамилия Мурсеев тяготеет к Поволжью и Приуралью — регионам, где веками жили крещёные татары, мишари и башкиры. В метрических книгах XIX века носители фамилии встречаются в Казанской, Уфимской и Симбирской губерниях. Интересно, что написание фамилии могло колебаться: в старых документах попадаются варианты Мурсаев, Мурсеев и даже Мурзсеев — последний, вероятно, под влиянием слова «мурза» (татарский князь), хотя этимологически это разные корни.

Социальный состав носителей был пёстрым. Среди Мурсеев встречались как государственные крестьяне, так и представители служилых татар — бывших мурз и казаков, которые после крещения переходили в русское сословие. Одна из ветвей фамилии, по данным ревизских сказок, осела в Оренбургской губернии среди казаков, что говорит о возможной военной службе предков.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Мурсеев заметно реже, чем Мурсалимов или Мурзаев. Это объясняется тем, что имя Мурсей было менее популярным, чем полная форма Мурсалим. В современных справочниках фамилия не входит в топ-5000, но имеет устойчивое бытование в Татарстане и Башкортостане, а также среди потомков поволжских переселенцев в Сибири.