Фамилия Мурынин — редкий случай, где суффикс -ин скрывает не отчество, а прозвище, привязанное к местности. В русской ономастике фамилии на -ин обычно образуются от основ на -а/-я (Иван → Иванов, но Иваня → Иванин). Здесь же основа «Мурын» — скорее всего, не личное имя, а прозвище или топоним.

Корень «мур» в русских говорах многозначен. В северных и сибирских диалектах «мурыжить» значит «тянуть, канителить, изводить», а «мура» — «чепуха, вздор» или «мелкая рыбешка». Человек по прозвищу Мурыня мог получить его за медлительность, приставучесть или несерьезность. Но есть и другая версия: в рязанских и тамбовских говорах «мурыга» — это бродяга или человек, живущий на отшибе. Тогда Мурынин — потомок такого «отшельника».

Интересно, что фамилия почти не встречается за пределами центральной России. Карта распространения показывает плотное гнездо в Нижегородской области и на севере Ивановской. Это наводит на мысль, что предок Мурыниных мог быть выходцем из деревни с похожим названием. В Костромской губернии, например, есть урочище Мурыгино, а в старых писцовых книгах упоминаются «мурынские» земли — запущенные, поросшие бурьяном участки.

Сравните с однокоренными фамилиями: Мурыгин, Мурылёв, Муринов. Если Мурыгин чаще связывают с диалектным «мурыга» (бродяга), то Мурынин стоит ближе к топониму или к прозвищу по месту жительства. Суффикс -ин здесь работает как притяжательный: «чей?» — «Мурынин», то есть сын или человек с того самого мурынского места.

Версия о тюркском следе (от имени Мурын — «нос» или «мыс») маловероятна: для татарских или башкирских фамилий типичен суффикс -ов, а не -ин. Так что перед нами чисто русская фамилия, корнями уходящая в диалектную лексику или микротопонимику центральных областей.