Фамилия Мурзякова — женская форма фамилии Мурзяков, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Мурзяк. Основа здесь — тюркское слово «мурза» (или «мирза»), которое в переводе означает «господин», «князь», «знатный человек». В русской среде это слово закрепилось как обозначение татарского дворянина или просто уважаемого человека, а затем перешло в разряд личных имён и прозвищ. Уменьшительный суффикс -як (Мурз-як) придаёт основе фамильярный или даже пренебрежительный оттенок, что характерно для русской народной традиции: так могли назвать младшего сына, слугу или просто человека невысокого роста, но с претензией на важность.

Суффикс -ов в мужской форме Мурзяков указывает на типичную русскую модель образования фамилий по принципу «чей?» — то есть «сын Мурзяка» или «принадлежащий Мурзяку». Поскольку фамилия заканчивается на -ов, а не на -ин, она относится к самой распространённой группе русских фамилий, возникших в среде крестьян и служилых людей. Географически Мурзяковы чаще всего встречаются в Поволжье и на Урале — в регионах, где исторически было сильное татарское и башкирское влияние. Сословно это, скорее всего, потомки государственных крестьян или казаков, поскольку дворянские фамилии с тюркской основой обычно имели более «чистую» форму без уменьшительного суффикса (например, просто Мурзаев или Мирзоев).

Интересная деталь: фамилия Мурзякова могла возникнуть и как «географическая» — от названия деревни Мурзяково, такие населённые пункты есть в Башкортостане и Татарстане. В этом случае основа та же, но фамилия указывает не на прозвище предка, а на место его жительства. В ономастических работах (например, у Б. Унбегауна) отмечается, что фамилии на -яков часто имеют двойное прочтение: либо от имени-прозвища, либо от топонима. Для Мурзяковой более вероятно первое — прозвищное происхождение, так как форма на -як в русских говорах активно использовалась для образования бытовых имён (сравните: Костяк, Петряк, Игнатяк).

Если говорить о редких вариантах, то раньше встречалось написание через «а» — Марзякова, что связано с акающим произношением в южнорусских и среднерусских говорах. Но современная орфография закрепила вариант с «у». Носители фамилии, скорее всего, не имели прямого отношения к татарской знати — прозвище «мурзяк» в крестьянской среде часто давали иронично, как насмешку над важным или заносчивым человеком. Так что предки Мурзяковых могли быть обычными землепашцами, получившими фамилию по уличному прозвищу, которое со временем потеряло ироничный оттенок и стало родовым именем.