Фамилия Мурзыков — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием скрывается нерусская, тюркская основа. Вопреки возможной догадке, корень здесь не связан ни с «мурлыканьем», ни с каким-либо животным. В основе лежит слово «мурза» (или «мырза»), которое в тюркских языках означало князя, знатного человека, представителя высшей аристократии. Изначально это не имя, а титул, звание, которое на русской почве могло превратиться в прозвище.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе «Мурзык» добавили патронимический суффикс -ов. Форма «Мурзык» — это уменьшительно-ласкательный или, точнее, фамильярный вариант от «мурза». Такое «снижение» титула через суффикс -ык (как, например, «князь» → «князик») было характерно для русской разговорной речи: им могли наградить татарского аристократа, оказавшегося на русской службе, или его потомка, которого в быту называли не по полному титулу, а по-свойски. Со временем это прозвище закрепилось за родом и стало наследственной фамилией.

Слово «мурза» прочно вошло в русский язык в эпоху Золотой Орды и последующих татарских ханств. Мурзами называли феодальную знать, которая часто переходила на службу к московским князьям. Поэтому фамилия Мурзыков, скорее всего, имеет корни в среде служилых татар, которые после крещения получали земли и вливались в состав русского дворянства. Однако полностью исключать более позднее происхождение от прозвища, данного за «барские» замашки или внешнее сходство с мурзой, тоже нельзя.

В отличие от фамилий вроде Мурзаев или Мурзин, где основа осталась без уменьшительного суффикса, форма Мурзыков указывает на более «бытовой» или даже ироничный контекст. Это не просто «сын мурзы», а скорее «сын того, кого звали Мурзык» — то есть прозвище уже успело пройти стадию адаптации в русской среде. Географически фамилия встречается в Поволжье, на Урале и в Сибири — в регионах, где исторически было сильно татарское влияние.

Сословная принадлежность первых носителей могла быть разной: от обедневших дворянских родов (князей и мурз, потерявших титул) до крестьян, получивших фамилию по прозвищу предка. Точных данных о массовом дворянстве Мурзыковых нет, но отдельные представители этой фамилии могли принадлежать к столбовому дворянству, если их предки вели род от ордынских выходцев.