Фамилия Мусаэлян образована от армянского мужского имени Мусаэл, а суффикс -ян указывает на принадлежность к роду. Если разобрать эту модель, то изначально фамилия значила «из рода Мусаэла» — так в армянской традиции закрепляли родство по отцу или основателю семьи. Сам термин «азганун», которым в армянском языке обозначают фамилию, буквально переводится как «имя клана», что хорошо объясняет, почему личное имя предка стало основой для целого семейного имени.

Происхождение имени Мусаэл вызывает споры, и здесь есть две основные версии. По одной из них, это армянский вариант еврейского имени Мафусаил (в оригинале — Метушелах). В Библии Мафусаил — один из праотцов человечества, сын Еноха и отец Ламеха, которого он родил в 187 лет. Имя стало нарицательным для долгожителя, отсюда выражение «мафусаилов век». Этимологию этого имени обычно выводят из древнееврейских слов «мавет» («смерть») и «шелах» («меч») или «шалах» («отсылать»). Согласно другой гипотезе, Мусаэл восходит к мусульманскому имени Мусал, которое переводят как «соглашающийся» или «простодушный». Правдоподобнее выглядит первая версия: она опирается на устойчивую библейскую традицию, а имя Мафусаил через греческое и армянское посредничество вполне могло видоизмениться в Мусаэла.

Армянская ономастика вообще впитала много разнородных элементов — еврейские, арабские, персидские и особенно турецкие влияния заметны в пласте личных имён, которые затем легли в основу фамилий. Мусаэлян здесь не исключение, хотя библейский след в этом имени выражен ярче, чем восточный. В культурах, где имя давали с установкой на будущее благо — здоровье, храбрость, удачу, — существовали и так называемые обрядовые имена, и имя Мафусаила, символизирующее долголетие, вполне могло выполнять такую роль: называя ребёнка в честь библейского долгожителя, родители как бы желали ему долгих лет.

Фамилия Мусаэлян встречается в основном в среде армян, как в самой Армении, так и в диаспоре, но точной географической привязки к какому-то одному региону или сословию нет — такие фамилии на -ян были распространены повсеместно среди армян независимо от социального положения. Известных исторических носителей этой фамилии, о которых можно было бы рассказать с уверенностью, в открытых источниках не зафиксировано, поэтому ограничимся тем, что есть: имя Мусаэл дало начало фамилии, которая до сих пор хранит память о родоначальнике и его библейском прообразе.