Фамилия Мусалатова — женская форма фамилии Мусалатов, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем или прозвищем Мусалат. Основа фамилии тюркская, и здесь мы сталкиваемся с редкой словообразовательной моделью для русского ономастикона. Суффикс -ов/-ев в фамилиях стандартно указывает на принадлежность («чей?» — сын Мусалата), но само имя Мусалат почти не встречается в крестильных святцах, что выдаёт его бытовое, прозвищное происхождение.

Корень «Муса» — это арабская форма библейского имени Моисей (Муса), широко распространённая у народов, исповедующих ислам: татар, башкир, народов Кавказа. Формант «-лат» может быть как частью сложного имени (например, Мусалатдин — «Моисей веры»), так и диалектным прозвищным окончанием. В тюркских языках «лат» иногда означает «латы», «доспехи», но в связке с именем Муса скорее всего работает как усилительная или ласкательная частица. Таким образом, Мусалат — это либо сокращённая форма от Мусалатдин, либо прозвище человека по имени Муса, получившее дополнительный суффикс.

Географически фамилия Мусалатовы тяготеют к регионам с сильным татарским и башкирским влиянием: Поволжье, Урал, отчасти Северный Кавказ. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках носители фамилии встречаются среди государственных крестьян и мещан, что типично для отатарившихся или обрусевших тюркских родов. Интересно, что фамилия сохранила окончание «-ов», а не «-ин» или «-ский», что говорит о её относительно позднем оформлении (XVII–XVIII века), когда стандартная модель «имя + -ов» уже вытесняла более архаичные формы.

Версия происхождения от славянского корня «мусалить» (пачкать, марать) маловероятна: она не объясняет ударения на последний слог (Мусала́тов) и не подкрепляется диалектными данными. Куда правдоподобнее, что предок носителя фамилии был человеком по имени Мусалат — возможно, муллой, торговцем или просто крестьянином, чьё прозвище закрепилось за потомками. Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, сосредоточены в нескольких конкретных родах, а не разбросаны по всей стране.