Фамилия Мусапиров — один из тех случаев, когда географическая привязка оказывается важнее морфологии. Перед нами типичная фамилия на -ов, образованная от личного имени или прозвища Мусапир. Но вот в чем загвоздка: в классических славянских именниках такого имени нет. Корень явно заимствованный, и ключ к разгадке — регионы, где фамилия встречается чаще всего: Казахстан, Узбекистан, Кыргызстан, а также среди татар и башкир.

Скорее всего, основа «Мусапир» восходит к арабскому или персидскому слову «мусафир» (مسافر) — «путешественник», «странник», «путник». В тюркских языках, особенно в казахском и узбекском, это слово закрепилось как «мусапир» с тем же значением. Первоначально так могли прозвать человека, который много странствовал, купца-путешественника, или же, в более бытовом смысле, гостя, остановившегося на ночлег. В мусульманской культуре понятие «мусафир» имеет и религиозный оттенок — так называют путника, которому разрешено сокращать молитвы.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с арабским именем Муса (Моисей) и тюркским аффиксом -пир (от персидского «пир» — старец, наставник, святой). Тогда «Мусапир» могло означать «последователь пророка Мусы» или «старец по имени Муса». Однако эта гипотеза слабее: при таком словообразовании форма была бы скорее «Мусапиров» от «Муса-пир», что встречается реже, чем прямая связь с «мусафир».

Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления фамилий, что типично для народов Поволжья и Средней Азии, входивших в состав Российской империи. Фамилию давали по отцу: «сын Мусапира». Значение фамилии, таким образом, прозрачно: предок носителя был либо странником, либо получил прозвище за склонность к путешествиям. Социальный состав носителей — в основном крестьяне и ремесленники, но встречаются и среди духовенства, так как «мусафир» — термин, знакомый каждому мусульманину.

В написании возможна путаница с фамилией Мусафиров — это один и тот же корень, но с разной степенью адаптации арабского звука. Вариант «Мусапиров» закрепился в тюркской среде, где глухой «п» заменил звонкий «ф» из-за особенностей произношения.