Фамилия Мушкатело — редкая, но очень показательная для южного, скорее всего украинского или молдавского, происхождения. Её главная особенность — суффикс -ел(о), который в восточнославянских фамилиях почти не встречается, зато типичен для молдавского (румынского) языка. В украинских фамилиях иногда появляется суффикс -ел(о) (например, Дятел, Шишел), но чаще он указывает на западноукраинское или бессарабское влияние. Таким образом, Мушкатело — это фамилия, образованная от прозвища с помощью суффикса, который придавал оттенок носителя качества.

Основа фамилии — мушкат. Это слово имеет два основных значения. Первое и самое вероятное — мускатный орех или мускатное вино. В южных регионах (Одесщина, Молдавия) «мушкат» — это сорт винограда и вино из него. Прозвище Мушкат мог получить винодел, торговец вином или просто любитель этого напитка. Второе значение — «мушкат» как уменьшительное от «муха» (в некоторых говорах). В таком случае прозвище могли дать мелкому, назойливому или быстрому человеку. Однако первая версия (винная) для юга гораздо органичнее, тем более что в Молдавии есть и фамилия Мушкат, и село Мушкаты.

Фамилия Мушкатело — патронимическая, то есть отвечает на вопрос «чей сын?». Суффикс -ел(о) можно трактовать как указание на принадлежность: «сын Мушката». В молдавском языке суффикс -ел (рум. -el) — уменьшительно-ласкательный, и фамилия могла означать «маленький Мушкат» или «Мушкатов внук». В украинской традиции подобные фамилии на -ел(о) иногда фиксировали прозвище в форме, близкой к звательному падежу, что тоже подчёркивает личное, «домашнее» происхождение.

Сословно фамилия, скорее всего, принадлежала крестьянам или мещанам. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Географически её следует искать в исторической Бессарабии (современная Молдавия и Одесская область Украины), а также на Западной Украине, где встречаются подобные словообразовательные модели. В современной России фамилия крайне редка и, вероятно, связана с переселенцами из указанных регионов.