Фамилия Муштаргов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, суффикс и ареал бытования указывают на восточные корни, скорее всего, тюркские или кавказские. Написание с конечным «-ов» выдаёт позднюю русификацию: фамилию привели к привычной для русской документации модели, но исходное прозвище или имя звучало иначе.

Ключ к разгадке — корень «муштар». В тюркских языках (особенно в кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском) слово «муштар» или «муштарлы» означает «желанный», «долгожданный», «любимый». Это типичное имя-пожелание, которое давали ребёнку, которого долго ждали или который родился после трудных родов. В этом случае Муштаргов — от имени Муштар с добавлением русского патронимического суффикса «-ов»: буквально «сын Муштара». Похожая модель встречается у фамилий Бекмурзов, Алиев, где личное имя переходит в фамилию без дополнительных суффиксов.

Есть и другая версия, менее вероятная, но заслуживающая упоминания. В арабском языке «муштар» — одна из форм глагола «быть общим» или «совместным». В дореволюционных документах так могли называть человека, владевшего имуществом на паях, или участника артели. Однако для прозвища это слишком книжно, а для имени — нетипично. Первая версия с тюркским именем-пожеланием выглядит убедительнее.

Географически фамилия Муштаргов встречается в рассеянных записях: единичные носители есть в Дагестане, Чечне, а также среди ставропольских туркмен и ногайцев. Это подтверждает связь с северокавказским и прикаспийским регионами, где тюркские имена были распространены веками. Сословно предки Муштаргов, скорее всего, были свободными крестьянами или казаками, так как фамилия не несёт признаков дворянского или духовного происхождения — нет суффиксов «-ский» или церковнославянской основы.

Написание фамилии устойчиво: ударение, вероятно, падает на второй слог — Мушта́ргов. Встречающийся изредка вариант Муштарга́ев — это уже совсем другая фамилия, с другим суффиксом и значением.