Фамилия Муслаева — женская форма от Муслаев. Её основа, скорее всего, связана с тюркским словом «мусла» — так в ряде тюркских языков называют место для молитвы, модельню или даже синагогу (от арабского «мусалла»). В русских говорах слово «мусла» тоже встречалось, но с другим значением: так могли называть кость, сустав или нечто выпирающее, торчащее. Отсюда и прозвище Мусло — человек с заметной костью, сутулый или, наоборот, костистый, худой.

Фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ев, который присоединяли к основам на мягкий согласный. Муслаев буквально означает «сын Мусла». Если исходить из тюркского корня, то предок мог быть служителем при молельне, муллой или просто набожным человеком. Если из русского — то обладателем прозвища по внешности.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались славянское и тюркское население: Поволжье, Приуралье, юг России. Встречается она нечасто, поэтому её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных родов. Сословная принадлежность Муслаевых не зафиксирована, но суффикс -ев и прозвищная основа указывают на крестьянскую или мещанскую среду — дворянские фамилии с такой формой редки.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «муслить» (пачкать, слюнявить). В этом случае Муслаем могли прозвать неряшливого человека. Однако такая гипотеза слабее: у фамилии нет характерного суффикса -ин, который обычно образуется от основ на -а/-я в глагольных прозвищах.