Фамилия Музальков — редкий пример, где корень слова почти полностью стёрт временем, а суффикс указывает на географию. Она образована по стандартной модели русского прозвища: основа + суффикс -к- (указывающий на лицо мужского пола) + фамильный суффикс -ов. То есть сначала было прозвище Музалько, а потом от него сделали фамилию — «чей?» — Музальков.

Главная сложность — в корне «музаль-». В русских говорах нет общеупотребительного слова «музаль». Самая вероятная версия — диалектное искажение слова «мусаль» или «музоль». В южнорусских и украинских говорах «мусаль» означало «замарашка», «неряха», «пачкун» — от глагола «мусать» (пачкать, мазать). Человек с таким прозвищем мог быть неопрятным или работать с грязью, сажей. Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным «музга» (сырость, слякоть) или «музюкать» (пачкать). В этом случае прозвище Музалько мог получить тот, кто жил в болотистой местности или постоянно ходил мокрым.

Суффикс -к- в основе (Музалько) типичен для украинской и белорусской прозвищной модели. Это значит, что фамилия Музальков, скорее всего, имеет западнорусское или малороссийское происхождение. Носители фамилии исторически концентрировались в Курской, Воронежской губерниях и на Слобожанщине — регионах, где смешивались великорусские и украинские говоры. В переписях XIX века фамилия встречается редко, что подтверждает её локальный, диалектный характер.

В отличие от более частых фамилий на -ов (Иванов, Петров), Музальков не привязан к каноническому имени или профессии. Его корень — чисто бытовое, часто уничижительное прозвище, которое давали по внешнему виду или привычке. Именно такие фамилии ценны для историка: они рассказывают не о церковных святцах, а о повседневной жизни крестьянина, его окружении и языке.