Фамилия Мышенко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в восточнославянской ономастике, изначально имел значение «сын», «потомок» или «маленький, молодой». В данном случае он прикреплён к основе «Мыша» — прозвищу или уменьшительной форме имени.

Корень «мыш-» может восходить к двум разным источникам. Первый и самый прямой — прозвище Мыша, которое давали человеку за внешнее сходство с мышью: невысокий рост, юркость, тихий голос, сероватый цвет волос или одежды. В народной культуре мышь — двойственный образ: с одной стороны, мелкий воришка и вредитель, с другой — символ хозяйственности и скрытности. Такое прозвище не обязательно было обидным — в среде крестьян и ремесленников его могли дать шутливо или по-соседски.

Вторая версия сложнее и интереснее. «Мыша» могло быть уменьшительной формой от крестильного имени Михаил (через народные варианты Михей, Миша, Мыша). Фонетический переход «и» в «ы» характерен для некоторых южнорусских и украинских говоров: Миша — Мыша. В таком случае Мышенко — это «Михайлович» по сути, но в народном, нецерковном звучании. Эта версия правдоподобна, потому что фамилии на -енко чаще всего образовывали от имён, а не от прозвищ.

Географически фамилия Мышенко тяготеет к левобережной Украине и югу России, где суффикс -енко особенно распространён. Встречаются также варианты Мышенков — результат русификации окончания при переезде носителей в великорусские губернии. Социально предки Мышенко — скорее всего, казаки или крестьяне, так как фамилии на -енко в XVII–XVIII веках активно закреплялись именно в этих сословиях Гетманщины и Слобожанщины.

Стоит заметить, что фамилия не имеет отношения к грызунам в прямом, зоологическом смысле. Как и в случае с Медведевыми или Волковыми, звериное прозвище — лишь метафора человеческих качеств. И если ваши предки носили фамилию Мышенко, скорее всего, родоначальник был либо невысоким и проворным человеком, либо просто Михаилом, которого в деревне звали на местный лад.