Фамилия Мышев образована от личного прозвища Мышь, которое восходит к названию известного грызуна. Это один из распространённых типов русских фамилий, где основой становится прозвище, данное человеку по какой-то характерной черте. Прямого указания на то, что предок был связан с ловлей мышей или торговлей ими, в прозвище нет, хотя полностью исключать ремесленную подоплёку нельзя. Чаще всего прозвище Мышь отражало особенности характера или внешности: так могли назвать скромного, тихого человека, который «сидел тише мыши», либо того, кто отличался запасливостью, доходящей до скупости, — по аналогии с мышью, делающей большие запасы. В некоторых говорах слово «мышь» использовалось и для обозначения невысокого, юркого человека, что также могло стать поводом для прозвища.

Суффикс -ев в фамилии указывает на притяжательное значение: Мышев — это «сын Мыша» или «человек из рода Мыша». Такая модель образования типична для русских фамилий, сложившихся в XV–XVII веках, когда прозвища отцов закреплялись за детьми и внуками. Точное место и время возникновения фамилии Мышев установить сложно: процесс формирования фамилий был длительным и шёл в разных регионах неравномерно. Однако фамилия нередко встречается в документах, связанных с северными и центральными областями России, что позволяет предположить её распространение именно оттуда. Стоит отметить и однокоренные фамилии — Мышкин, Мышаков, Мышин, — которые образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что говорит о широкой популярности прозвища в народной среде. Таким образом, фамилия Мышев — это не просто родовое имя, а живой памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе память о прозвище, которое когда-то метко охарактеризовало своего первого носителя.