Фамилия Мыслин образована от прозвища Мысля. В основе лежит глагол «мыслить», значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет как «думать, размышлять, судить умом, соображать или полагать; помышлять». Прозвище Мысля, скорее всего, указывало на особенности характера и поведения основателя фамилии: ум, сообразительность, смекалку. Так человека, известного своим рассудительным нравом, могли выделить среди соседей и закрепить за ним это именование. Со временем прозвище Мысля легло в основу фамилии Мыслин: потомки такого человека стали носить её как родовое имя.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: к основе Мысл- добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность роду. Буквально фамилия отвечала на вопрос «чей?» — сын Мысли, человек из рода Мысли. Такая модель чаще встречалась в северных и центральных русских говорах, где прозвищные имена на -а (-я) были особенно распространены. В южнорусских регионах аналогичную фамилию могли бы образовать с суффиксом -ов, получив вариант Мыслов, но закрепился именно Мыслин.

Интересно, что прозвище Мысля не обязательно несло исключительно положительную оценку. В народной речи «мыслями» могли называть не только умного, но и задумчивого, немного отрешённого человека, склонного к долгим размышлениям. В некоторых говорах слово «мысля» употребляли иронично, в значении «тихоня, который всё обдумывает, но медлит с решением». Поэтому фамилия могла закрепиться и за человеком с задумчивым, созерцательным характером, а не только за выдающимся острословом.

Родственные фамилии — Мыслов, Мысляев, Мысливцев — образованы от тех же корней и прозвищ, но с разными суффиксами. Такое разнообразие показывает, насколько живым и употребительным было слово в разных регионах. В документах XVI–XVII веков встречаются упоминания крестьян и посадских людей с подобными именованиями, что говорит о народном, недворянском происхождении фамилии.