Фамилия Мысская — редкий случай, когда географическая основа очевидна, а вот способ её оформления выдаёт необычную модель. В отличие от привычных Мысов, Мысовых или Мысников, здесь работает суффикс -ск-, который в русских фамилиях чаще всего указывает на происхождение от названия населённого пункта. То есть Мысская — это не «сын человека по прозвищу Мыс», а «та, что родом из Мыска» или «из Мысска». Такое окончание типично для дворянских «географических» фамилий (по имени поместья), но в крестьянской среде оно тоже встречалось, если семья переселилась из другого села и получила прозвище по прежнему месту жительства.

Корень мыс- многозначен. В топонимике это и мыс — выступ берега, и диалектное «мыс» в значении «лесной клин», «возвышенность». На карте России есть несколько деревень Мыс, Мысы, Мысок — от Архангельской области до Сибири. Носитель фамилии мог получить её при переписи, если его предки жили в таком селе или на самом мысу при слиянии рек. Мужской вариант — Мысский — встречается ещё реже, а женская форма Мысская закрепилась, вероятно, через вдов или незамужних женщин, записанных в документах без мужа.

С точки зрения словообразования интересно, что фамилия сохранила окончание прилагательного женского рода. В русской традиции фамилии на -ская обычно не меняют род: Мысская остаётся Мысской и для мужчины, и для женщины, хотя в быту могли говорить «Мысский» про главу семьи. Такая двойственность говорит о том, что фамилия зафиксирована относительно поздно, в XIX веке, когда канцелярии уже не переделывали женские формы на мужские.

По сословной принадлежности судить сложно. Фамилия не даёт намёка на ремесло или прозвище, а значит, её носители, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, получившими фамилию от места жительства. Среди духовенства и дворянства Мысская не встречается — слишком прозрачная и «местная» основа. В современных справочниках фамилия крайне редка, её можно встретить в центральной России и на Урале, что косвенно подтверждает версию о переселенцах из северных или волжских деревень Мыс.