Фамилия Мытаркин звучит драматично, но её значение не имеет прямого отношения к «мытарствам» в современном смысле — страданиям и злоключениям. В основе лежит слово «мытарь», которое в Древней Руси означало сборщика податей и пошлин. «Мытарство» как процесс сборов было делом прибыльным, но не слишком почётным в народе, отсюда и переносный смысл — «мучительство».

Разберём словообразовательную модель. Фамилия образована с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: Мытаркин — это «сын (или потомок) Мытарки». А Мытарка — это не самостоятельное имя, а производная форма от прозвища Мытарь, скорее всего с уменьшительно-пренебрежительным оттенком. То есть предок был не просто мытарем, а «мытаркой» — мелким сборщиком или человеком, который постоянно ходил по мытарствам (пунктам сбора пошлин).

В ономастике встречается и другая версия: прозвище Мытарка могли дать человеку с тяжёлым, придирчивым характером — того, кто «мытарит» других, то есть изводит, требует, не даёт покоя. Но первая, «профессиональная», версия правдоподобнее: фамилии от должностей (Кузнецов, Попов, Пономарёв) массово возникали в среде служилых и посадских людей, а сборщики податей были фигурами заметными.

Интересная деталь: фамилия Мытаркин — редкая и почти не встречается за пределами России. В отличие от распространённых Мытовых или Мытаревых, форма с суффиксом -кин указывает на конкретную северную или центрально-русскую традицию образования фамилий от прозвищ на -ка. Это не дворянская, а крестьянская или мещанская фамилия, возникшая не ранее XVI–XVII веков, когда прозвища начали закрепляться в качестве наследственных имён.