По одной из версий, она восходит к киргизским словам «мы» и «зын», которые переводятся на русский язык как «двигаться» и «издавать звон; подражательное слово». Возможно также, что фамилия связана со словами «мы» и «зы», которые на языке черкесов Адыгеи и Красноярского края означают «яблоко» и «один» соответственно. Согласно еще одной гипотезе, данная фамилия имеет туркменские корни и ведет свое начало от слова «мызал» — «пример». Наконец, нельзя исключать, что фамилия Мызын может происходить от арабского слова mizan, т.е. «Весы» (созвездие). Мизаном также называется седьмой месяц Солнечного года (с 22 сентября по 21 октября). Поэтому старину мальчикам, родившимся в этом месяце, давали имя Мизан.