Фамилия Набишев образована от мужского имени Набиш, которое является краткой, обиходной формой арабского имени Наби (Набий). В переводе с арабского «набий» означает «пророк» — один из эпитетов, которые в мусульманской культуре давали мальчикам, желая им высокой духовности или божественной защиты. Имя было распространено у народов, исповедующих ислам: среди татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии.

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от тюркских или арабо-персидских основ. В данном случае фамилия строится по схеме «имя предка + патронимический суффикс»: Набиш → Набишев, то есть «сын (или потомок) Набиша». Такая словообразовательная модель типична для фамилий, которые закреплялись в XVIII–XIX веках у татарских и башкирских родов, а также у народов Северного Кавказа, чьи имена и прозвища адаптировались к русской грамматике при записи в метрики и ревизские сказки.

Важная деталь: фамилия Набишев — не единственная в этом ряду. Однокоренные фамилии Набиев, Набиуллин, Набижанов образованы от того же корня, но с разными суффиксами и окончаниями, характерными для разных языковых групп. Набишев отличается именно краткой формой имени-основы без дополнительных аффиксов, что делает её более редкой по сравнению, например, с массовой фамилией Набиев.

Географически фамилия Набишев встречается в Татарстане, Башкортостане, а также среди азербайджанцев и кумыков, но не имеет ярко выраженного регионального центра — носители рассеяны по разным областям России и бывшего СССР. Это говорит о том, что фамилия возникла в разных местах независимо, каждый раз от местного носителя имени Набиш.

Известных публичных фигур с такой фамилией в открытых источниках не зафиксировано, что типично для фамилий, которые не успели попасть в энциклопедии или медиапространство. Однако это не умаляет её ценности: Набишевы — потомки людей, носивших имя, отсылающее к пророческому сану, что в исламской традиции считалось почётным и ответственным.