Фамилия Нагог — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на нетипичную модель образования. Скорее всего, это фонетический вариант или искажение другой фамилии, либо прозвище, застывшее в краткой форме.

Первый и наиболее вероятный путь — связь с тюркскими корнями. В тюркских языках слово «наг» (nag) означает «драгоценный камень», «самоцвет» или «жемчуг». Встречается и значение «блестящий», «сияющий». В таком случае прозвище Нагог могло относиться к человеку с яркой внешностью, либо к ювелиру или торговцу самоцветами. Удвоение «г» на конце — типичное для южнорусских говоров и украинского языка явление, где прозвища нередко получали такой «усиленный» суффикс (ср. Бородаг, Шуляг). Таким образом, Нагог — это «тот, кто связан с нагом», то есть с камнем или блеском.

Вторая версия — искажение польской или белорусской фамилии Nagóg или Nagoga. В польском языке nagić (нагич) означает «обнажать», а nagi — «голый». Прозвище Нагога могли дать бедняку, человеку без имущества, или же тому, кто ходил в рваной одежде. При переходе в русскую среду окончание могло переосмыслиться как -ог, и фамилия закрепилась в форме Нагог. Такое явление встречалось при переселении крестьян из западных губерний в центральную Россию.

Третья, менее вероятная гипотеза — связь с древнерусским словом «нагъ» (голый, нагой). Но тогда ожидалась бы фамилия Нагов или Нагин, а не Нагог. Если же предположить, что это краткое прилагательное, то оно должно было бы склоняться: «он Нагог», «у Нагога». Такая форма встречается в северных говорах, где прозвища в именительном падеже сохраняли усечённое окончание (например, Босой — Босог). Однако это редкий случай, и большинство ономастов склоняются к тюркской или западнославянской версии.

Географически фамилия Нагог встречается единично, преимущественно в Волгоградской и Ростовской областях, а также в Краснодарском крае. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: именно в этих регионах было сильное влияние ногайского и татарского языков. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками, поскольку дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В исторических документах фамилия не упоминается, что говорит о её локальном и позднем оформлении — скорее всего, в XVIII–XIX веках.