Фамилия Наличаев — один из тех случаев, где нестандартный суффикс сразу выдаёт происхождение. В русских фамилиях редко встретишь формант -аев при основе на твёрдый согласный (обычно было бы -ов: Наличов). Этот нюанс указывает на то, что перед нами не прямая русская модель, а фамилия, сложившаяся в среде, где действовали иные фонетические законы. Скорее всего, речь о тюркском влиянии: в тюркских языках притяжательный аффикс мог давать именно такое окончание, а при адаптации на русской почве «ч» осталось мягким, что и закрепило вариант -аев вместо -ов.

Основа фамилии — налич. Проще всего подумать о слове «наличник» (резное украшение окна) или о «наличных» деньгах. Но вряд ли предок торговал наличными — для прозвища это слишком абстрактно. Куда логичнее связать фамилию с ремеслом: наличник делал наличники, то есть был плотником или резчиком по дереву. В русских говорах слово «наличник» известно повсеместно, а прозвище Налич или Наличник могли дать мастеру, который «наводил красоту» на окна. В таком случае Наличаев — потомок того самого резчика.

Есть и вторая версия, менее очевидная, но лингвистически возможная. В некоторых тюркских языках (например, в карачаево-балкарском) есть слово «налыч» или «налич» со значением «подкова» или «железная оковка». Если предок был кузнецом или торговал скобяными изделиями, прозвище Налич могло закрепиться за ним, а уже русский суффикс превратил его в фамилию.

Географически фамилия Наличаев встречается в основном на юге России — в Ростовской области, Краснодарском крае, а также в Поволжье. Это как раз те регионы, где веками шло смешение русского и тюркского населения. Так что обе версии — и ремесленная, и тюркская — имеют под собой почву, но первая (с наличником) проще и понятнее для рядового носителя фамилии.

По сословной принадлежности сказать что-то определённое сложно: Наличаевы не фигурируют в дворянских родословных книгах, значит, скорее всего, предки были крестьянами или мещанами. Фамилия нередкая, но и не массовая — её носители живут компактно, что тоже говорит о локальном происхождении от одного прозвища.