Основой фамилии Наумкин послужило церковное имя Наумка. Фамилия Наумкин восходит к крестильному мужскому имени Наумка (уменьшительная форма от Наум) которое в переводе с древнееврейского означает «утешающий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Наумка, со временем получил фамилию Наумкин.