Фамилия Недеев — редкий пример того, как в основе родового имени оказалось слово с неочевидной, а потому особенно интересной судьбой. Образовали её по самой распространённой на Руси модели: от прозвища Недей с помощью патронимического суффикса -ев, который добавляли к основам на мягкий согласный. Проще говоря, Недеев — это «сын Недея», и главный вопрос кроется в том, что же значило само прозвище.

Здесь исследователи расходятся. Наиболее правдоподобной выглядит версия, связывающая прозвище с украинским словом «недея», что означает «дикая вершина горы». В этом случае Недей — человек, живший у такой вершины, в гористой местности, и прозвище указывало на место жительства основателя рода. Такая топонимическая привязка встречается часто: людей называли по имени реки, озера, урочища или горы, мимо которой стоял их дом.

Существует и другая, менее убедительная гипотеза. Она возводит прозвище к церковнославянскому глаголу «деять» — «делать, действовать» — с отрицательной частицей не-. Тогда Недей — человек, которого окружающие характеризовали через отсутствие действия: нерешительный, медлительный, склонный к бездействию. Эта версия логична, но слабее первой: прозвища, построенные на отрицании глагола, в русской ономастике встречаются, но реже, чем прозвища от географических реалий.

Важно и то, что фамилия сохранила старую форму написания с буквой «е» после «д». В некоторых однокоренных фамилиях, например Неделин или Недешев, основа та же, но суффиксы разные, что говорит о самостоятельном, независимом возникновении каждой из них в разных семьях. А вот фамилия Недеев закрепилась именно за потомками того самого Недея, чьё прозвище со временем перестало быть личной характеристикой и превратилось в родовое имя.