Фамилия Нефедичев образована от имени Нефед, народной формы канонического имени Мефодий. В русской бытовой традиции начальное «Ме» часто отпадало или упрощалось, так что Мефодий превращался в Нефёда. Ударение в фамилии на второй слог: Нефедичев.

Словообразовательная модель здесь не самая частая. Суффикс -ичев указывает на отчество от имени Нефед, но с патронимическим суффиксом -ич, который в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин. Полная цепочка: Нефед → Нефедич («сын Нефеда») → Нефедичев («внук Нефеда»). Такая форма характерна для северных и центральных областей России, где отчества на -ич дольше сохранялись в быту и переходили в фамилии. В южных и западных регионах чаще встречается вариант Нефедов.

Имя Мефодий греческого происхождения, означает «методичный», «следующий порядку». В святцах оно связано с равноапостольным Мефодием, создателем славянской письменности, но в крестьянской среде имя распространилось в упрощённом виде Нефёд. Носители фамилии Нефедичев — потомки человека, которого в документах записывали как Нефедич, то есть «сын Нефеда».

Встречаемость фамилии невысокая, что делает её интересной для генеалогического поиска. Среди однокоренных — Нефёдов, Нефедьев, Нефёдкин, но Нефедичев выделяется именно редкостной суффиксальной конструкцией. Если искать предков, стоит обратить внимание на переписи и метрики Вологодской, Костромской и Архангельской губерний — там фамилии на -ичев фиксировались чаще.