Фамилия Негматов происходит от арабского мужского имени Нигмат, которое в диалектном произношении звучало как Негмат. В арабском языке это имя многозначно: оно передает понятия «счастье, обилие, богатство», а также «подарок», «яства, кушанья», «удовольствие и наслаждение» и даже «милосердие, сочувствие». Такая смысловая емкость делала имя привлекательным для мусульманских народов, у которых оно получило широкое хождение в разных фонетических вариантах — Нимат, Намат, Нимук.

Словообразовательная модель фамилии проста и прозрачна: к основе Негмат добавлен русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность к отцу. То есть Негматов — это буквально «сын Негмата». Такая модель типична для фамилий, которые складывались у тюркских и кавказских народов в XIX–XX веках, когда в официальное делопроизводство активно входили русские окончания. Суффикс -ов здесь не несет этнической окраски, а лишь оформляет фамилию по общероссийскому стандарту.

География фамилии охватывает регионы, где традиционно исповедовали ислам и использовали арабские имена: Средняя Азия, Поволжье, Северный Кавказ, отчасти Закавказье. У татар, башкир, узбеков, таджиков имя Нигмат и его формы встречались часто, поэтому фамилия Негматов могла возникнуть независимо в нескольких местах. Это не редкая, но и не массовая фамилия; ее носители сегодня живут в России, Узбекистане, Таджикистане и в диаспорах за рубежом.

Отдельного внимания заслуживает написание через «е» в первом слоге. Литературная арабская форма имени — Нигмат, но в живой речи многих тюркских языков редуцированный гласный звучал ближе к «е», что и закрепилось в документах. Поэтому Негматов и Нигматов — это не разные фамилии, а варианты одной, разошедшиеся из-за особенностей произношения и записи. Встречающийся вариант Нагматов отражает уже более сильное изменение гласного, характерное для некоторых диалектов.

Сословного барьера у фамилии не было: ее могли носить и потомки духовных лиц, и торговцы, и крестьяне. Имя Нигмат не было привилегией знати, оно встречалось в самых разных слоях общества. Поэтому по фамилии Негматов нельзя уверенно судить о социальном происхождении предков — это скорее маркер культурной и религиозной традиции, чем указание на род занятий.

В ономастической литературе фамилию обычно рассматривают в ряду других арабо-мусульманских имен, адаптированных русским суффиксом. Словарь Б. Унбегауна, посвященный русским фамилиям, напрямую ее не разбирает, но описанная модель полностью соответствует тем процессам, которые он прослеживает для заимствованных имен. Смысловой центр фамилии — пожелание счастья и благополучия, которое родители вкладывали в имя сына, и этот оттенок сохраняется за фамилией до сих пор.