Фамилия Негра почти наверняка связана с прозвищем, а не с этнической принадлежностью предка. В основе лежит нарицательное «негр» — так в старину называли «чернотелого человека, арапа, уроженца знойной Африки». Но вряд ли предки носителя этой фамилии были родом из Африки: скорее, Негрой в деревне прозвали своего, русского человека за внешнее сходство — смуглую кожу, черные волосы или темные глаза. Такие прозвища по цвету волос и лица были обычным делом, поэтому версия о внешности выглядит самой правдоподобной.

Интересно, что фамилия сохранила старую, книжную форму слова. В народной речи чаще говорили «негр» без изменений, а вот в письменных источниках и в просторечии XIX века встречался вариант «негра» — как раз в значении «чернокожий человек». Фамилия закрепила именно эту форму, что делает её редкой и немного архаичной.

Есть и третья, совсем экзотическая гипотеза: связь с топонимом Негрыш — городом в Тверской области. Но она не выдерживает критики: название города имеет финно-угорские корни, а фамилия образована по модели прозвищ, а не по географическому принципу. Если бы предок был родом из тех мест, мы бы скорее увидели фамилию Негрышев или Негорский, а не Негра.

Сама фамилия образована без суффикса, напрямую от прозвища, что говорит о её древности. Такие бессуффиксные фамилии чаще встречались на юге России и в казачьих областях, где прозвища легко переходили в фамилии без изменений. В северных и центральных губерниях к основе обычно добавляли -ов или -ин, поэтому форма «Негра» выдаёт южное или западнорусское происхождение рода.

Стоит добавить, что в некоторых говорах слово «негра» могло использоваться и как бранное, и как шутливо-ласковое — для темноволосого ребёнка. Так что фамилия могла закрепиться за родом, где из поколения в поколение рождались чернявые дети, и прозвище стало семейным. Сегодня фамилия Негра встречается редко, но её носители могут быть уверены: их предок выделялся внешностью и получил меткое прозвище, которое пережило века.