Фамилия Негря — один из тех случаев, где внешняя простота обманчива. На слух фамилия звучит как прилагательное или прозвище в краткой форме, но на деле перед нами типичная восточнославянская фамилия молдавско-румынского происхождения, адаптированная русской письменностью.

Корень здесь — румынское слово «negru», то есть «чёрный». В Молдавии и на юго-западе Украины фамилия Негря (Negrea) довольно распространена. Она образована по продуктивной модели: от основы прилагательного «негр(у)» (чёрный) с помощью суффикса -я, который в румынской ономастике часто указывает на принадлежность или характерный признак. Буквально — «чернявый», «смуглый», «темноволосый». В русской среде фамилию не стали переделывать на «Негров» или «Негринов», а сохранили в исходном звучании, что указывает на сравнительно позднее вхождение — скорее всего, в XIX–XX веках, в период активных миграций из Бессарабии.

Интересно, что фамилия Негря не имеет ничего общего с негроидной расой, хотя ухо русского человека может провести ложную параллель. В молдавских говорах «негру» — обычное обозначение цвета, и прозвище давали за внешность: тёмные волосы, смуглая кожа, реже — за тёмную одежду или род занятий (например, работа с углём). Поскольку суффикс -я не даёт однозначного указания на патроним (в отличие от русского -ов/-ев), фамилия могла закрепиться и как прозвище, и как родовое имя без дополнительного переоформления.

Географически фамилия тяготеет к югу: Молдавия, Одесская область, Приднестровье. В центральной России она редка, и если встречается, то почти всегда у потомков переселенцев из Бессарабии или у людей, чьи предки сменили фамилию при записи в документах. Сословной привязки нет — Негря могли быть и крестьянами, и мещанами, и священниками, поскольку румынское влияние на юге Российской империи не знало строгих сословных перегородок по языковому признаку.

В ономастических справочниках фамилию обычно связывают со словарём молдавских фамилий, где она стоит в одном ряду с Негру, Негреску и Негрица. Вариант Негря — самый краткий, без дополнительных суффиксов, что делает его похожим на исходное прозвище, а не на позднюю книжную форму.