Фамилия Нехорина — женская форма, а мужская, Нехорин, принадлежит к распространённому типу русских фамилий на -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Нехорин буквально значит «сын Нехори» или «из семьи Нехори». Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Нехоря.

Корень слова — «хорь» (хищный зверёк из семейства куньих). Приставка «не-» могла придавать значение отрицания или, что вероятнее в русской ономастике, служить частью охранительного имени. В древности родители могли назвать ребёнка Нехорей, чтобы «отвести» от него качества зверя — хитрость, вороватость или неприятный запах. Такая практика называлась «охранительными именами»: считалось, что имя-оберег (например, Некрас, Нелюб, Нехорош) отпугивает злых духов. Прямое значение прозвища Нехоря — «не хорёк», то есть человек, которого сравнивают с хорьком, но с отрицанием, смягчающим характеристику.

Менее распространённая версия связывает фамилию с диалектным глаголом «хорить» — в некоторых говорах это означало «бранить, ругать, корить». Тогда Нехоря — тот, кого не бранят, не ругают, то есть человек покладистый или всеми любимый. Однако эта гипотеза слабее, так как глагол редок и не имеет широкого распространения в источниках.

Фамилия Нехорин встречается в основном в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской и Рязанской областях, а также на Урале. Это говорит о том, что прозвище бытовало в крестьянской среде, где такие «звериные» имена были обычны. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с похожими фамилиями (Нехорошев, Нехлюдов), что подтверждает модель образования от охранительных имён.

Таким образом, предок современного носителя фамилии Нехорин, скорее всего, был человеком, получившим в быту прозвище Нехоря — возможно, как оберег от нежелательных качеств, либо как ироничное указание на внешность или поведение. Фамилия эта редкая, но её происхождение прозрачно и укладывается в старую русскую традицию имён-оберегов.