Фамилия Неклютина — женская форма фамилии Неклютин. В её основе лежит нецерковное имя или прозвище Неклюд, которое в древнерусском языке означало «нелюдимый», «необщительный», «неласковый» человек. Слово «неклюдь» фиксируется в памятниках письменности с XV века: так называли того, кто сторонится людей, ведёт замкнутый образ жизни или отличается суровым нравом. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Неклютин буквально — «сын Неклюда».

Интересно, что в русских говорах у этого корня была и вторая жизнь. В некоторых областях «неклюжим» называли неуклюжего, неловкого человека, а также того, кто не пригоден к делу. Однако для фамилии Неклютин более вероятно исходное значение «нелюдимый» — такие прозвища давали не в обиду, а как характеристику, которая затем закреплялась за родом.

В ономастике фамилия нередкая, но не массовая. Встречается в основном в центральных и северных регионах России. Есть параллельные формы — Неклюдов (от той же основы, но с суффиксом -ов), а также Неклюжев, образованный от прилагательного «неклюжий». Неклютины могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми — прозвище не указывало на сословие, а лишь на особенность характера первого носителя.

Спорных версий происхождения у фамилии немного. Иногда её связывают с диалектным глаголом «неклюдить» — «безобразничать, проказить», но это менее убедительно: глагол появился позже и не дал устойчивого прозвищного ряда. Наиболее достоверным остаётся объяснение через «нелюдь» — древнюю характеристику человека, который жил сам по себе.