Фамилия Нешин в большинстве случаев — это след от старинного имени Неша. Так на Руси в просторечии называли человека, носившего крестильное имя Нестор. Само имя пришло из греческого языка и означает «вернувшийся домой», что в древности воспринимали как пожелание благополучного пути и возвращения к родному очагу. В церковном календаре это имя связано сразу с несколькими святыми: преподобным Нестором Летописцем, автором «Повести временных лет», а также мучениками Нестором Магидийским и Нестором, победившем языческого бойца в поединке благодаря молитвам святого Димитрия.

Словообразовательная модель проста: к основе Неш- добавили типичный русский суффикс -ин, который указывает на принадлежность. То есть Нешин буквально означает «сын Неши» или «человек из семьи Неши». Такая модель чаще встречается в северных и центральных русских говорах, где имена с уменьшительными формами на -ша были особенно употребительны.

Существует и вторая, менее распространённая версия происхождения. Она связывает прозвище Неша с украинским словом «несить», то есть «не насытиться». В этом случае прозвище закреплялось за человеком, которого трудно было накормить, либо за тем, кто не довольствовался малым и постоянно искал большего. Чередование согласных с/ш здесь не случайность, а результат естественных фонетических процессов в языке. Однако эта версия выглядит менее убедительной: прозвища, построенные на глаголах с отрицанием, встречаются реже, чем сокращённые формы имён.

Интересно, что фамилия Нешин не получила широкого распространения, что говорит о её сравнительно позднем закреплении в определённых семьях. Её можно встретить в документах, связанных с крестьянским и мещанским сословиями, где прозвищные имена часто переходили в фамилии без изменений. Родственными по происхождению можно считать фамилии Нестеров и Несторов, но Нешин стоит особняком: он сохранил более архаичную, народную форму имени, которая в письменных источниках почти не фиксировалась.