Фамилия Нешин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. В её основе лежит имя Неша — просторечная форма мужского крестильного имени Нестор, которое в переводе с греческого означает «вернувшийся домой». Такое значение отсылает к древней традиции: так могли назвать ребёнка, родившегося после долгого отсутствия отца, или человека, чудом вернувшегося из дальней дороги.

Святыми покровителями этого имени считаются сразу несколько подвижников. Самый известный — Нестор Летописец, преподобный Печерский, автор «Повести временных лет». Также почитаются священномученик Нестор, епископ Магидийский, распятый на кресте в Пергаме во время правления Детия, и святой мученик Нестор, который с благословения Димитрия Солунского поборол на поединке языческого бойца, убивавшего христиан, за что и был казнён в 306 году.

Существует и вторая, менее очевидная гипотеза. Согласно ей, фамилия Нешин восходит не к имени, а к прозвищу Неша, которое связывают с украинским глаголом «несить». В таком случае прозвище означало «человек, которого трудно накормить, насытить; всегда голодный», а также «не удовлетворяющийся ничем достигнутым». Соответственно, такое прозвище, скорее всего, давали человеку с отменным аппетитом или тому, кто постоянно искал большего. Чередование согласных с/ш в этом случае — результат исторических процессов, происходивших в языке.

Какая версия правдоподобнее? Первая выглядит убедительнее. Имя Нестор было широко распространено на Руси, а его уменьшительные формы вроде Неша или Нешка органично вписываются в словообразовательную модель. Прозвищная версия хоть и возможна, но опирается на единичный диалектный глагол, который вряд ли дал бы устойчивое семейное имя.

Сам суффикс -ин в фамилии Нешин указывает на принадлежность: он отвечает на вопрос «чей?» и означает «сын Неши» или «человек из рода Неши». Такой тип фамилий — один из самых древних и распространённых в северных и центральных русских землях, где притяжательные прилагательные с -ин и -ов закрепились раньше, чем в других регионах.

О точном месте и времени возникновения фамилии Нешин говорить сложно: процесс формирования фамилий был длительным и занял несколько столетий. Однако можно предположить, что она бытовала в тех краях, где имя Нестор было особенно любимо, — например, в новгородских и псковских землях, где церковные имена часто принимали просторечные формы.