Фамилия Ничипорухаев — один из тех редких случаев, когда мы можем проследить не только корень, но и цепочку смысловых переходов от имени к прозвищу, а затем к фамилии. В основе лежит каноническое имя Никифор (от греческого «никофорос» — «несущий победу»). В народной, бытовой речи имя быстро обрастало уменьшительными и пренебрежительными формами. На украинских и южнорусских землях имя Никифор превратилось в Ничипор (через чередование «к» и «ч», характерное для восточнославянских говоров). От этой формы и пошло прозвище Ничипоруха — то есть человек, которого в обиходе звали Ничипором, но с оттенком фамильярности или шутки (суффикс -уха/-юха в восточнославянских языках часто придаёт слову просторечный, иногда грубоватый оттенок: «Василь» — «Василюха», «Михайло» — «Михайлюха»).

Сама фамилия образовалась по стандартной модели: к основе прозвища Ничипорух- добавился типичный русский фамильный суффикс -аев (фонетический вариант суффикса -ев после шипящих и мягких согласных). Таким образом, Ничипорухаев — это «сын Ничипорухи», то есть потомок человека, которого звали Ничипоруха.

Интересна география фамилии. Она явно тяготеет к зоне украинско-русского пограничья: Курская, Белгородская, Воронежская области, а также восток Украины (Сумская, Харьковская области). Именно там имя Никифор в форме «Ничипор» было особенно распространено. Фамилия довольно редкая — её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких близких родов, а не из разных областей, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска.

С точки зрения социального происхождения, Ничипорухаевы — почти наверняка крестьянский род. Сложная, «трёхэтажная» фамилия (имя → прозвище → фамилия) с просторечным суффиксом -уха редко встречалась у дворянства или духовенства, предпочитавших более «книжные» формы. Предок-основатель, скорее всего, был простым земледельцем или ремесленником, которого в деревне знали как Ничипоруху — возможно, за весёлый нрав, задиристость или какую-то внешнюю черту, ставшую поводом для прозвища.

Сравните с однокоренными фамилиями: Ничипоров — прямая, «чистая» форма от имени; Ничипоренко — украинская модель на -енко; Ничипорук — западноукраинский вариант на -ук. Фамилия Ничипорухаев стоит особняком: она сохранила ту самую промежуточную, «прозвищную» ступень, которая в других случаях давно стёрлась.