Фамилия Николахин образована от имени Николаха — так в народе, в бытовом общении, называли человека по имени Николай. Само имя Николай пришло из греческого языка и буквально означает «народный победитель»: греческое «ника» — победа и «лаос» — народ. Имя это пришло на Русь вместе с христианством и быстро стало одним из самых любимых: Николая Чудотворца почитали и крестьяне, и князья, поэтому и производных форм от этого имени возникло великое множество — Никола, Никула, Микола, Никаша, Николаха.

Фамилия Николахин относится к типу так называемых «полуотчеств»: ее основа — не полное каноническое имя, а его обиходная, уменьшительно-ласкательная форма. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Николахин буквально значит «сын Николахи», «тот, кто из рода Николахи». Такая модель словообразования была распространена повсеместно, но особенно часто встречалась в северных и центральных русских говорах, где имена с суффиксом -ах(-а) были в ходу: Степаха, Ванеха, Петряха. Поэтому Николахин — фамилия не редкая, но и не массовая, она сохранила живой отпечаток народной речи.

Интересно, что от того же имени Николаха, но с другими суффиксами, возникли и родственные фамилии — Николахин, Николахинский, Николушкин, Николин. Разница лишь в том, какой именно вариант имени закрепился в конкретной семье. Потомок человека по прозвищу Николаха со временем получал фамилию Николахин, и она передавалась уже по наследству, не меняясь, даже если сам носитель носил совсем другое имя.