Фамилия Николенко восходит к каноническому мужскому имени Николай (с греческого Nikolaos: nika – «побеждать» и laos – «народ»), точнее - к одной из его производных форм, звучавшей как Никола. Среди других обладателей этого имени, причисленных к лику святых, - Николай Салос, блаженный, псковский юродивый. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Никола, со временем получил фамилию Николенко.