Фамилия Николишина образована от мужского имени Николиша — старинной, ласковой народной формы канонического имени Николай. Само имя Николай пришло на Русь из греческого языка и восходит к Nikolaos, где nika означает «побеждать», а laos — «народ». То есть в буквальном переводе Николай — «победитель народов». Однако в основе фамилии лежит не само полное имя, а именно его краткий обиходный вариант Николиша, который был очень популярен в повседневной речи на Руси. Такие уменьшительные формы (Николиша, Микола, Коля) использовались в быту повсеместно, и именно они чаще всего становились основой для фамилий.

При разборе фамилии важно обратить внимание на суффикс. Форма Николишина — это женский вариант фамилии, а мужской, Николишин, построен по классической модели притяжательных прилагательных с суффиксом -ин. Такой суффикс указывает на принадлежность: Николишин означает «чей?» — сын, внук или потомок человека по имени Николиша. Подобная модель широко распространена в русской ономастике и встречается у фамилий, образованных от имен, оканчивающихся на -а или -я (например, Мишин, Сашин, Кузьмин).

Народная этимология связывает прозвище Николиша не только с именем, но и с народными традициями. Фамилию мог получить ребенок, родившийся на Никольщину — так в народе называли праздник святителя Николая Чудотворца, который отмечают дважды в году: 22 мая (Никола Вешний) и 19 декабря (Никола Зимний). В эти дни было принято широко гулять, и существовал даже глагол «николить», означавший «праздновать, гулять, пьянствовать». Поэтому прозвище Николиша могли дать не только по имени, но и человеку веселому, любящему погулять в праздничные дни. Обе версии имеют право на жизнь, но первая — от имени — выглядит более правдоподобной, так как образование фамилий от уменьшительных форм имен было самым массовым явлением в русской ономастике.

Таким образом, фамилия Николишина (и мужская Николишин) — это типичный пример русской фамилии-отчества, которая закрепилась за потомками человека, носившего имя Николиша. Это имя, в свою очередь, отсылает нас к почитаемому на Руси святому Николаю Угоднику, покровителю путешественников и земледельцев. Фамилия эта довольно редкая и встречается преимущественно в центральной России и Поволжье, где традиции имянаречения уменьшительными формами сохранялись особенно долго.