Фамилия Никутина — женская форма от Никутин, и её происхождение напрямую связано с разговорным вариантом имени Никита. В русском языке имя Никита в бытовой речи часто сокращали до Никута: так звучало ласковое или просторечное обращение. От этой формы с помощью патронимического суффикса -ин и образовали фамилию, которая буквально означает «сын Никуты» или «потомок Никуты». Модель образования здесь классическая для северных и центральных русских говоров: суффикс -ин указывает на принадлежность к конкретному человеку, а не на географическое название.

Особенность фамилии Никутин в том, что её основа — не каноническое церковное имя, а его народная переделка. В древнерусской антропонимии так называли не только в крестьянской среде, но и среди посадских людей, где имена и прозвища нередко смешивались. Суффикс -ута характерен для уменьшительных форм: Никута стоит в одном ряду с Ванюта, Микута, Петрута. Такие имена фиксировались в писцовых книгах XVI–XVII веков, особенно на Русском Севере и в Поволжье.

Географически фамилия Никутин (и, соответственно, Никутина) традиционно чаще встречается в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, а также в Пермском крае. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были, скорее всего, государственными или черносошными крестьянами, которые жили на общинных землях. Дворянских родов с такой фамилией в исторических источниках не прослеживается — это фамилия «простая», народная, без гербов и титулов.

Есть и вторая, менее вероятная версия: в некоторых говорах «никута» могло означать «неуклюжий, нерасторопный человек». Однако связь с именем Никита гораздо убедительнее, потому что в ономастике именно личные имена дают основную массу фамилий на -ин. Если ваша фамилия Никутина, то с большой долей уверенности можно считать, что ваш предок по мужской линии носил имя Никута — так в быту называли Никиту.