Фамилия Нишук — восточнославянская, с прозрачной словообразовательной моделью, но неочевидной основой. Суффикс -ук (или -чук, как в этом случае) типичен для украинских и белорусских фамилий: он обозначает сына, ученика или человека, связанного с тем, что названо корнем. Нишук — это буквально «маленький Ниш» или «потомок Ниша».

Корень «Ниш-» в этой фамилии — самый интересный. Скорее всего, это усеченная форма крестильного имени. В православных святцах есть имя Никита (через греческое «победитель»), а в народном произношении оно нередко сокращалось до Ниш. Такой же путь прошли фамилии Нишев, Нишин, Нищук. Менее вероятная, но возможная версия — связь с польским или белорусским словом «ниша» (низкий, приземистый), но для прозвища это слишком книжно и редко.

Географически фамилия Нишук чаще всего встречается на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в южной Беларуси. Это зона влияния украинской модели на -ук/-чук. В России она редка и, скорее всего, появилась в результате миграций XX века. Социально предки Нишуков — скорее всего, крестьяне или мещане, поскольку фамилии на -ук в этой среде были массовыми и формировались как патронимы: сын Никиты становился Нишуком.

Сравните с однокоренными: Нищук (с тем же корнем, но с шипящим «щ» — результат местного произношения) или Нишкевич (польско-белорусская версия с другим суффиксом). Фамилия Нишук не дворянская и не купеческая — её история укладывается в простую схему: было имя Никита, в обиходе — Ниш, и сына назвали Нишук. Никакой тайны, но именно эта прозрачность и делает фамилию наглядным документом народной антропонимии.