Фамилия Нистор образована от канонического мужского древнегреческого имени Нестор. Нестором в греческой мифологии звали царя Пилоса, одного из участников Троянской войны. В «Илиаде» он изображался старцем, славящимся мудростью и житейским опытом. В данном случае за основу фамилии была взята украинская форма этого имени – Нистор. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Нестор, со временем получил фамилию Нистор.