Фамилия Низина — один из тех случаев, когда географическое прозвище закрепилось за родом без изменений, в чистой форме, без типичных суффиксов принадлежности. Это «топонимическая» фамилия, образованная от названия места жительства: низина — низкое место, лощина, впадина, расположенная ниже окружающей местности. Человек, живший в такой низине или у подножия холма, получал прозвище Низина, которое затем перешло к его детям и внукам.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Большинство русских фамилий образуются с помощью суффиксов -ов/-ев, -ин, -ский. Низина же — это субстантивированное прилагательное или существительное в чистом виде, что характерно для украинской и белорусской традиции (сравните: Жук, Ворона, Сосна). В русском быту такие фамилии тоже встречались, но реже — их чаще давали в среде крестьян и казаков, где прозвище могло закрепиться в документах как есть, без переделки в «Низин» или «Низинский».

Версия о происхождении от диалектного слова «низина» (в некоторых говорах — «низкий, приземистый человек») менее вероятна, но возможна. Если прозвище давали по росту, логичнее было бы использовать «Низкий», «Низов» или «Низин». Однако в рязанских и тамбовских говорах «низина» могло означать и «бедняк», «человек низкого сословия» — пренебрежительное, но нередкое прозвище.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и западнорусским регионам. Встречается на Смоленщине, Брянщине, в Белгородской области — там, где рельеф часто описывали через противопоставление «верх — низ». В украинской среде фамилия могла писаться как Низина (без изменения окончания), а в белорусской — встречается в форме Нізіна.

Интересная деталь: в старых писцовых книгах и ревизских сказках фамилию Низина могли записать с одним «н» — Низина, что не меняет смысла, но иногда путает исследователей. В отличие от фамилии Низин (с ударением на первый слог), ударение в Низина чаще падает на второй слог, что подчёркивает именно ландшафтное значение — «живущий в низине».