Фамилия Ноздрунов имеет прозвищное происхождение: её основа — личное прозвище Ноздрун, которое, в свою очередь, связано с существительным «ноздри». Чаще всего такие прозвища давали людям с яркой внешней особенностью, но у слова мог быть и другой смысл. Согласно одной из версий, Ноздруном называли гончара: в глиняной посуде, которую обжигали в печи, проделывали специальные отверстия — «ноздри» для выхода воздуха. Так прозвище из разряда «профессиональных» могло указывать на род занятий предка.

Родственные именования зафиксированы в «Ономастиконе» академика С.Б. Веселовского. Там упоминаются князь Иван Иванович Ноздрун Жировой-Засекин (начало XVI века) и Иван с Михаилом Григорьевичами Ноздруновы из Твери (1540 год). Эти записи показывают, что прозвище бытовало в разных слоях общества — и среди знати, и среди служилых людей. Интересно, что у князя Ноздрун выступает вторым, неофициальным именем, что было распространённой практикой в допетровской Руси.

Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность потомку: Ноздрунов — сын или внук Ноздруна. Модель образования типична для русских фамилий, оформившихся к XVII веку. Со временем прозвище закрепилось как основное именование человека, а затем перешло в фамилию, которую унаследовали его дети.

Среди известных носителей — Борис Митрофанович Ноздрунов, музыковед, кандидат искусствоведения, участник Великой Отечественной войны. Его биография — редкий случай, когда о человеке с этой фамилией сохранились публичные сведения.

Сама фамилия остаётся довольно редкой, и её география сегодня не привязана к какому-то одному региону. Но твёрская запись 1540 года позволяет предположить, что ядро рода могло сложиться именно в верхневолжских землях.