Фамилия Омаева почти наверняка японского происхождения, а не русского. В русской ономастике фамилий с таким корнем и окончанием не зафиксировано. Основа «Омае» восходит к японскому слову «омаэ» (お前) — местоимению «ты», которое в разные исторические периоды могло звучать либо фамильярно, либо грубовато, либо, в средневековье, как уважительное обращение к вышестоящему. Фамилия Омаева, скорее всего, образована по стандартной японской модели: к личному имени или прозвищу Омаэ добавили суффикс -ва (-和), означающий «мир», «гармония» или «род». В русском языке фамилия получила типичное для женского рода окончание -а, но носителем может быть и мужчина (Омаев).

Гораздо реже, но теоретически возможна версия, что фамилия — результат искажения при переписи. Если предки жили в регионах с тюркским или кавказским населением, исходная фамилия могла звучать как Омаев (от имени Ома, варианта Ума или Омар) с последующей заменой буквы. Однако японский корень — основная и самая логичная версия, особенно если носитель или его предки имеют отношение к Дальнему Востоку.

В Японии фамилия Омаева не входит в число распространённых, но встречается. Она не связана с каким-либо конкретным сословием или ремеслом — это скорее фамилия-прозвище, закрепившаяся за конкретной семьёй. В русском контексте фамилия остаётся редкой и экзотической, её носители — почти наверняка потомки смешанных браков или люди, чьи предки эмигрировали из Японии.