Фамилия Онищенко звучит как типичная украинская фамилия, и это действительно так: её создали по модели с суффиксом -енко, который в старину означал «сын такого-то». Буквально Онищенко — это «сын Ониська». Но за этим простым на первый взгляд разбором скрывается целый клубок имён, который уходит корнями в греческий язык и православные святцы.

Разберём основу. Имя Онисько — это просторечная, обиходная форма сразу двух крестильных имён: Онисим и Онисифор. Оба имени греческие. Онисим переводится как «полезный», а Онисифор — как «несущий пользу». В старину от Онисима образовалось и несколько других форм, которые тоже встречаются в документах: Онисий (или Анисий) и Онис (Анис). Возможно, Онисько возникло не напрямую от полной формы, а опосредованно — от этих укороченных вариантов. В православной традиции почитают шесть святых с именем Онисим, одного — Онисий и четырёх — с именем Онисифор, так что имя было распространённым и давало много простора для народного словотворчества.

Впрочем, есть и более широкая версия происхождения основы. Некоторые исследователи выводят фамилию от мирского имени Оня — ласкательной формы, которую использовали более чем для двух десятков личных имён, как мужских, так и женских: Семён, Иона, Леонтий, Флегонт и другие. В «Ономастиконе» Степана Веселовского упоминаются Онищины, записанные в 1525 году в Каргополе. Это раннее свидетельство бытования родственной фамилии на русском севере, что показывает: имя было ходовым далеко за пределами Украины.

Теперь о фонетике. При присоединении суффикса -енко к основе Онисько произошло закономерное для славянских языков изменение: сочетание «ськ» перешло в мягкий звук «щ». Так и получилось современное Онищенко. Это не искажение, а естественный фонетический процесс, который хорошо прослеживается и в других фамилиях на -енко. С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: перед нами классический патроним, то есть указание на отца по имени.

Среди носителей фамилии есть люди, которые сделали её известной далеко за пределами Украины. Самый, пожалуй, скандально известный — Борис Григорьевич Онищенко, советский пятиборец, серебряный призёр Олимпийских игр 1968 года; его спортивная карьера закончилась громким скандалом на Играх 1976 года. Широкая публика также знает Геннадия Григорьевича Онищенко, долгие годы занимавшего пост главного санитарного врача России. Из научной среды стоит упомянуть Алексея Семёновича Онищенко (1933 года рождения), заслуженного деятеля науки и техники Украины, философа и культуролога. В целом среди Онищенко много спортсменов, военных, врачей и деятелей искусства — что неудивительно для фамилии с такой давней и разветвлённой историей.