Основой фамилии Онищенко послужило мирское имя Оня. Фамилия Онищенко восходит к имени Оня, которое является производной формой более двадцати личных имен, как мужских, так и женских: Семен, Онисий, Флегонт, Иона, Леонтий и других. В «Ономастиконе» Веселовского есть Онищины, 1525 г., Каргополь. Наиболее известные представители данной фамилии – серебряный призер Олимпийских игр 1968 года в пятиборье Борис Григорьевич Онищенко и главный санитарный врач России Геннадий Григорьевич Онищенко. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Оня, со временем получил фамилию Онищенко. Фамилия Онищенко образована от имени Онисько — просторечной формы крестильного имени Онисим или Онисифор. Оба этих имени имеют греческое происхождение. Онисим в переводе означает «полезный». Это имя послужило основой для возникновения других форм, также довольно популярных в старину: Онисий (Анисий) и Онис (Анис). Вполне вероятно и то, что имя Онисько образовалось опосредованно, то есть возникло не из формы Онисим, а из имен Онисий или Онис. Онисифор же (в просторечии — Анцифер) переводится как «несущий пользу». В истории православия известно шесть святых покровителей имени Онисим, один — Онисий и четыре — имени Онисифор. Фамилия Онищенко образована при помощи украинско-белорусского суффикса -енко. Поэтому Онищенко буквально понималось как «сын человека по имени Онисько». В соответствии с фонетическими закономерностями при присоединении суффикса -енко сочетание звуков «ськ» изменилось на «щ». Среди людей, прославивших фамилию Онищенко, есть спортсмены, военные и научные деятели, художники. Одним из наиболее известных однофамильцев является Алексей Семенович Онищенко (родился в 1933 году), заслуженный деятель науки и техники Украины вошедший в историю как видный ученый-философ и культуролог.