Фамилия Орфаниди — редкий для России пример фамилии греческого происхождения, сохранившей родовой суффикс -ди. В русском языке такие фамилии почти не склоняются и сразу выдают иностранные корни носителя.

Основа фамилии — греческое слово «орфанос» (ορφανός), что означает «сирота». Соответственно, Орфаниди — это «сын сироты» или, в более широком смысле, «сиротский». Суффикс -ди (часто встречается в форме -idis, -ides) в греческой ономастике — типичный патронимический показатель, аналог русского -ов/-ев или -ин. Он указывал на принадлежность к роду: Иоанниди — сын Иоанна, Христофоров — сын Христофора. В данном случае прозвище или имя отца было не личным именем, а характеристикой — «сирота».

Вероятнее всего, фамилия закрепилась за ребёнком, который рано потерял родителей, либо за взрослым, получившим такое прозвище по стечению обстоятельств (например, воспитанник общины или монастыря). В греческой среде прозвища, данные по социальному положению или семейному статусу, не были редкостью.

На территорию Российской империи фамилия попала вместе с волнами греческих переселенцев — прежде всего в XVIII–XIX веках. Греки селились в Причерноморье (Одесса, Мариуполь, Таганрог, Крым), на Кавказе и в Закавказье. Именно в этих регионах и сегодня можно встретить носителей фамилии Орфаниди, хотя в центральной России она остаётся единичной.

С точки зрения словообразования интересно, что фамилия не обрусела — не получила русских суффиксов, как это случилось, например, с фамилией Орфанов (от того же «орфанос»). Орфаниди сохранила исконную греческую форму, что говорит о достаточно позднем и компактном переселении предков, которые долго держались своего языка и традиций именования.