Фамилия Пакалин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Пакалин, вероятно, образована от прозвища Пакала, которое восходит к украинскому глаголу «пакати», что значит «жечь трубку». Очевидно, это прозвище указывает на особенности поведения предка: скорее всего, он был пристрастен к курению трубки. По другой версии, фамилия Пакалин представляет собой фонетический вариант фамилии Покалин. В этом случае фамилия образована от прозвища Покаля, которое, вероятно, связано с глаголом «покалить». Следовательно, Покалей могли прозвать человека, причастному к кузнечному делу и калению железа. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пакала или Покаля, со временем получил фамилию Пакалин. О точном месте и времени возникновения фамилии Пакалин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Пакалин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.