Фамилия Пахолько звучит не по-русски, и это верная подсказка. Перед нами яркий пример украинской или белорусской фамилии, образованной с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -к- и патронимического окончания -о. Такая модель (Коваль — Ковалько, Гриць — Грицько) была характерна для западнорусских земель, входивших в Речь Посполитую, и указывала на принадлежность к определённому роду: Пахолько — буквально «маленький Пахол» или «сын Пахола».

В основе фамилии лежит имя Пахол — просторечная, народная форма канонического крестильного имени Пахомий. Пахомий греческого происхождения и означает «широкоплечий», «тучный». В русских говорах имя быстро редуцировалось: Пахом превращался в Пахола (через суффикс -л-, который придавал оттенок фамильярности, как в «Михайла» вместо «Михаил»). Таким образом, Пахолько — это «внук Пахома», причём прозвище закрепилось за младшим поколением, когда деда уже звали полным именем.

Не стоит путать эту фамилию с русской Пахомов. Суффикс -ов в русском языке — притяжательный («чей сын?» — Пахомов), а украинско-белорусское -ко выполняло ту же функцию, но было более демократичным и распространённым среди крестьянства и казачества. Если Пахомовы могли быть выходцами из северных и центральных областей России, то Пахолько почти наверняка родом из Черниговщины, Полтавщины, Гродненщины или Волыни — регионов, где фамилии на -ко составляют до трети всех родовых имён.

Интересна и альтернативная, хотя и менее вероятная, версия: прозвище Пахол могло произойти не от имени, а от древнерусского слова «пахолок» — «слуга», «мальчик», «подросток». В этом случае Пахолько — потомок человека, которого в молодости звали пахолком (в отличие от взрослого «мужа»). Однако эта гипотеза слабее: в ономастике принято считать, что подавляющее большинство фамилий с суффиксом -ко восходит к личным именам, а не к нарицательным словам. К тому же имя Пахом было очень популярно в XVI–XVII веках, что даёт прочную статистическую базу.

В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается в написаниях Пахолько и Пахолько — чередование «о/ы» (Пахол/Пахыл) характерно для юго-западных говоров. В современной России Пахолько остаётся редкой фамилией, но её носители живут в Краснодарском крае, Ростовской области и, конечно, на Украине и в Беларуси.