Фамилия Пакшинцева — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Пакшинцев. Эта фамилия редкая и почти не встречается за пределами центральной России. Её происхождение напрямую связано с русским словом «пакша», которое в диалектах Вологодской, Архангельской и Костромской губерний означало «щека», «скула». В переносном смысле «пакшой» называли человека с крупными или выпирающими скулами, а иногда — того, кто любит много и громко говорить (от «распакшить» — раскрыть рот, разинуть).

Модель образования фамилии типична для русского Северо-Запада и Поволжья: основа «Пакшин» (от прозвища Пакша) плюс суффикс -цев. Такая конструкция (на -инцев/-ынцев) встречается реже, чем обычные -ов или -ин, и обычно указывает на то, что фамилия сформировалась не в крестьянской среде, а позже, в мещанской или купеческой, когда появилась потребность уточнить принадлежность к роду: «Пакшинцев» буквально означает «сын Пакшина», то есть внук или потомок человека по прозвищу Пакша.

В отличие от более распространённой фамилии Пакшин (чистое -ин), форма Пакшинцев имеет дополнительный суффикс, который часто встречается в фамилиях, образованных от названий населённых пунктов или от отчеств на -ин. Однако в данном случае речь идёт именно о прозвище: географических точек с корнем «Пакшин» в России не зафиксировано. Таким образом, предок носительницы фамилии почти наверняка жил в северных или центральных губерниях (Вологодчина, Ярославщина, Нижегородская область) и получил прозвище по внешней примете — выдающимся скулам.

Сословно фамилия Пакшинцев, судя по редкости и словообразованию, могла принадлежать к свободным крестьянам или посадским людям, а не к дворянству. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия встречается единично, и её носители не входили в число известных исторических родов. Современная распространённость крайне мала: Пакшинцевы живут в основном в Нижегородской области и Москве, что подтверждает северно-русский след.