Фамилия Панчишен — редкий случай, когда суффикс подсказывает не только географию, но и социальный срез. Перед нами не стандартное русское -ов или -ин, а украинский или белорусский суффикс -енко, который в южнорусских говорах часто редуцировался в -ен, а затем через мягкое -ен дал форму Панчишен. Фактически это видоизменённое Панчишенко, где -ен указывало на «малого», «потомка»: Панчишен — сын Панчиша или внук Панька.

Основа фамилии — Панчиш, разговорная форма от имени Пантелеймон или Панкрат. В украинской и белорусской традиции имена часто усекали до Панько, Панча, Панчиш — последняя форма с суффиксом -иш, который придавал оттенок уменьшительности или даже пренебрежительности (как в Ванька — Ваниш). То есть Панчиш — это «маленький Панько» или «Панька, сын Пантелеймона». Фамилия, таким образом, отчественная: её дали по отцу или деду, которого в быту звали Панчиш.

Географически фамилия тяготеет к юго-западным областям России — Курской, Белгородской, Воронежской, а также к восточным районам Украины (Сумская, Харьковская области). Именно там переход -енко в -ен и последующее смягчение согласного — нормальный фонетический процесс. В официальных документах XIX века такая фамилия могла записываться как Панчишенко, но в быту и при переписи крестьян её упростили.

Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или казачья. Фамилии на -енко в малороссийских губерниях были типичны для свободных сельских обывателей и казаков, а не для дворянства. Никаких громких исторических личностей с такой фамилией в дореволюционных справочниках не зафиксировано — это говорит о том, что носители оставались в рамках своего уезда, не попадая в столичные списки.

Интересная деталь: написание через -шен, а не -щен (Панчищен) указывает на то, что фамилия сложилась в устной речи раньше, чем её записали чиновники. В русском языке после шипящих под ударением писали «о», но в безударном положении в фамилиях часто закреплялось то, что слышалось: Панчишен, а не Панчищён. Это типичная «народная» орфография, которая сохранилась до наших дней.