Фамилия Паночишен — редкий случай, когда украинская патронимическая модель накладывается на польскую или белорусскую основу. В её центре — имя или прозвище Паночиш, а суффикс -ен указывает на происхождение: «сын Паночиша». Такая словообразовательная цепочка встречается в западноукраинских землях, особенно в Галичине и на Волыни, где веками смешивались восточнославянские и польские антропонимические традиции.

Корень «Паноч-» скорее всего восходит к польскому panocz, уменьшительной форме от pan — «пан», «господин». В украинском языке это слово могло звучать как «паночок» — обращение к мелкому шляхтичу, хозяину или просто уважаемому человеку. Таким образом, первый носитель прозвища Паночиш мог быть сыном небогатого пана, либо же его так дразнили за барские замашки. Вторая версия — связь с личным именем Пантелеймон или Панкратий, где «Паноч-» могло быть народным сокращением, но это менее вероятно из-за чёткой польской окраски слова.

Фамилия почти не встречается за пределами западных областей Украины. В дореволюционных метрических книгах её можно найти в сёлах под Львовом, Тернополем и Ровно. В России и Беларуси она единична — скорее всего, результат поздних переселений. Написание «Паночишен» закрепилось в русской передаче; в оригинале фамилия могла выглядеть как Паночишень або Паночишин — в зависимости от местного говора и акцента.

Социально предки Паночишенов, судя по географии и корню, принадлежали к крестьянству или мелкой шляхте. Никаких громких исторических фигур с такой фамилией не известно — это типичная фамилия-прозвище, застывшая в той форме, в какой её записал священник или писарь. Её главная особенность — редкость и чёткая региональная привязка, что делает её ценным маркером для генеалогического поиска на западе Украины.