Фамилия Паночин (и её вариант Паночины) образована от личного имени предка, а именно от производной формы Паноча. Это имя — уменьшительно-ласкательный вариант канонического имени Павел, которое в переводе с латыни означает «маленький». Для славянской традиции типично создавать краткие обиходные формы имён, поэтому Паноча вполне могла возникнуть в бытовой речи как ласковое обращение к ребёнку или младшему члену семьи.

Сам Павел — один из самых известных апостолов в христианском мире, называвший себя «апостолом язычников». Его почитание широко отразилось в народном имясловии, что дало множество производных фамилий. Однако у имени Паноча есть и другие возможные источники. Не исключено, что это форма древних греческих имён Пантелеймон («всемилостивый»), Панкрат («всемогущий») или Панфил («всеми любимый»). В народной среде такие длинные имена часто сокращали до первого слога или до созвучного сочетания, поэтому Паноча могла закрепиться за носителем любого из них.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Паночин буквально означает «сын Паночи», «ребёнок Паночи». Такая модель типична для северорусских и части центральнорусских территорий, где притяжательные прилагательные с -ин образовывались от имён, оканчивающихся на -а или -я. Это отличает фамилию от более распространённых на юге и востоке форм на -ов/-ев.

Потомок человека по имени Паноча со временем получил фамилию Паночин. Безусловно, она представляет собой памятник славянской культуры, сохранивший в себе следы живого народного словообразования. Но процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности: семьи переезжали, писцы по-разному записывали прозвища, и один корень давал несколько ветвей. Поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Паночин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований, а пока мы можем уверенно реконструировать её имя-основу и ту среду, где она возникла.